Надежность идентификации модельных трипептидов с использованием электрораспылительной и тандемной масс-спектрометрии
T3N1
Надежность идентификации модельных трипептидов
с использованием электрораспылительной и
тандемной масс-спектрометрии при сравнении
со справочными и теоретическими спектрами
Б.Л. Мильман
ГФУП «Всероссийский научно-исследовательский институт метрологии
им. Д.И. Менделеева», Московский пр. 19, 198005 Санкт-Петербург, Россия.
E-mail: bmilman@mail.rcom.ru
Поступила в редакцию 17.08.2005 г.; после переработки — 15.11.2005 г.
Проведено сравнение результатов идентификации коротких модельных пептидов при использовании электрораспылительной (ЭР) и тандемной (МС2 ) масс-спектрометрии и альтернативных подходов, основанных на библиотечном поиске и сравнении с теоретическими спектрами. Для исследования выбран полный набор изомерных трипептидов, содержащих аргинин, лейцин или изолейцин, лизин. Спектры МС2 , полученные с использованием столкновительной активации и двух различных способов ввода растворов в масс-спектрометр (прямой ввод раствора или ВЭЖХ), и поиски в электронных библиотеках соответствующих масс-спектров обеспечили надежную идентификацию изученных пептидов как пар Leu/Ile. Указанные способы ввода растворов различались составом и потоком подвижной фазы, что приводило к неполному совпадению соответствующих простых (МС1 ) массспектров ЭР и, как следствие, к ошибкам в идентификации при использовании справочных спектров. Библиотечный поиск с привлечением спектров МС2 , зарегистрированных для ионов-предшественников с m/z 86, позволил надежно различить остатки аминокислот Leu and Ile для 11 из 12 изомеров. Сравнение с теоретическими спектрами обеспечивает правильную идентификацию не более 50–67% пептидов (пар Leu/Ile). Причиной ложных результатов в данных случаях является частое совпадение масс характеристичных ионов различных соединений. При уменьшении воспроизводимости спектров МС2 библиотечный подход к идентификации также может давать ложные результаты, и возможности обоих методов распознавания пептидов сближаются.
