Масс-спектрометрическое de novo секвенирование пептидов
T3N4
Масс-спектрометрическое de novo секвенирование
пептидов
К.А. Артеменко, Т.Ю. Самгина, А.Т. Лебедев
Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, химический
факультет, Ленинские горы 1, строение 3, 119992 Москва, Россия
E-mail: lebedev@org.chem.msu.ru
Поступила в редакцию 16.09.2006 г.
Установление аминокислотной последовательности белков является одной из наиболее актуальных задач современной химии, биологии, медицины. Масс-спектрометрия зарекомендовала себя превосходным методом для решения этой задачи и стала важнейшим инструментом недавно сформировавшегося научного направления — протеомики. Благодаря экспрессности, информативности и надежности метода он успешно конкурирует c классическими биохимическими вариантами секвенирования пептидов. Еще одним достоинством масс-спектрометрии является возможность не толь-ко быстро детектировать присутствие в образце десятков и сотен уже известных пептидов и белков, но и устанавливать структуру ранее не исследованных полипептидов. Такой вариант анализа получил название «de novo секвенирование». Именно ему и посвящен настоящий обзор.