Определение участков апомиоглобина, образующих межмолекулярные взаимодействия в амилоидных агрегатах методом масс-спектрометрии высокого разрешения

T13N4

Наталья Сергеевна Катина, Мария Юрьевна Суворина,
Елизавета Игоревна Григорашвили, Виктор Викторович Марченков,
Наталья Александровна Рябова, Алексей Донатович Никулин,
Алексей Константинович Сурин

 Образование амилоидных агрегатов в органах и тканях человека вызывает развитие серьезных неизлечимых заболеваний. Однако экспериментальное исследование механизма амилоидообразования белков и структурных характеристик амилоидов является сложным из-за гетерогенности и высокого молекулярного веса агрегатов. В данной работе для определения участков полипептидной цепи апомиоглобина, образующих межмолекулярные взаимодействия в амилоидных структурах, использовались методы ограниченного протеолиза и масс-спектрометрии. Методом тандемной масс-спектрометрии удалось определить участки полипептидной цепи миоглобина, формирующие остов амилоидных структур. Показано, что основными структурными элементами формирования остова амилоидных фибрилл в миоглобине являются участки с 60 по 90 и с 97 по 124 аминокислотный остаток. Данные участки хорошо совпадают с теоретически предсказанными. Описанный подход позволил получить важную информацию о структурированности белковых молекул в агрегатах, а также о конформационных перестройках апомиоглобина в процессе амилоидообразования.

Назад к содержанию

GroupFilter: программное решение проблемы дискриминации идентификаций масс-спектров высокого разрешения при работе поискового алгоритма Morpheus

T12N4

Марк Витальевич Иванов, Лев Игоревич Левицкий,
Анна Александровна Лобас, Михаил Владимирович Горшков Читать полностью

Идентификация пептидов в «скорострельной» протеомике методами тандемной масс-спектро метрии

Вернуться к оглавлению

T12N1

Идентификация пептидов в «скорострельной» протеомике
методами тандемной масс-спектро метрии: сравнение
поисковых алгоритмов

М.В. Иванов, Л.И. Левицкий, А.А. Лобас,
И.А. Тарасова, М.Л. Придатченко, В.Г. Згода,
С.А. Мошковский, Г. Митулович, М.В. Горшков Читать полностью

Исследование эффективности существующих алгоритмов идентификации пептидов

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T3N4

Исследование эффективности существующих
алгоритмов идентификации пептидов

С.Е. Певцов Читать полностью

Идентификация пептидов по хроматомасс-спектрометрическим данным

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T5N1

Идентификация пептидов
по хроматомасс-спектрометрическим данным
с использованием расчета времен удерживания

И.А. Тарасова^а, Р.А. Зубарев^б, А.А. Голобородько^в, А.В. Горшков^г,
М.В. Горшков^{а Читать полностью}