О характеристиках триптических пептидов, способствующих их обнаружению и идентификации методом масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией

T15N3

Борис Львович Мильман, Анастасия Владимировна Соловьева,
Наталья Владимировна Луговкина, Инна Константиновна Журкович

Определены и обсуждаются характеристики триптических пептидов, способствующие обнаружению и идентификации этих соединений и соответствующих белков методом масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (МАЛДИ) с α-циано-4-оксикоричной кислотой в качестве матрицы. Идентифицировано 25 белков; проведено сравнение характеристик надежно идентифицированных пептидов, и тех соединений, которые потенциально могли образоваться при трипсинолизе, но не были обнаружены. Установлены два основных фактора, которые повышают шансы обнаружения исследованных пептидов. Первый из них касается основности пептидов в газовой фазе, которая достигает наиболее высоких значений у пептидов с С-концевым остатком аргинина; эта природа появления значительных аналитических сигналов хорошо известна. Второй фактор, содействующий ионизации рассматриваемых пептидов в условиях МАЛДИ с данной матрицей, представляет собой их гидрофильность. Этот результат не согласуется с выводами большинства проведенных ранее релевантных исследований и обсуждается в статье.

Назад к содержанию

Масс-спектрометрическое de novo секвенирование пептидов

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T3N4

Масс-спектрометрическое de novo секвенирование
пептидов

К.А. Артеменко, Т.Ю. Самгина, А.Т. Лебедев Читать полностью

Влияние органических добавок на увеличение интенсивности сигналов протонированных пептидов в масс-спектрах матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T4N1

Влияние органических добавок на увеличение
интенсивности сигналов протонированных пептидов
в масс-спектрах матрично-активированной лазерной
десорбции/ионизации

В.А. Горшков, К.А. Артеменко, Т.Ю. Самгина, А.Т. Лебедев Читать полностью

Защитные пептиды, выделенные из кожного секрета европейской озерной лягушки Rana ridibunda

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T4N2

Защитные пептиды, выделенные из кожного
секрета европейской озерной лягушки
Rana ridibunda

К.А. Артеменкоа, Т.Ю. Самгинаа, А.Т. Лебедева, Дж.Р. Дойлб,
Л.Е. Льюелинб, Д. Билусичв, Дж.Х. Бовив Читать полностью