Определение участков апомиоглобина, образующих межмолекулярные взаимодействия в амилоидных агрегатах методом масс-спектрометрии высокого разрешения
T13N4
Наталья Сергеевна Катина, Мария Юрьевна Суворина,
Елизавета Игоревна Григорашвили, Виктор Викторович Марченков,
Наталья Александровна Рябова, Алексей Донатович Никулин,
Алексей Константинович Сурин
Образование амилоидных агрегатов в органах и тканях человека вызывает развитие серьезных неизлечимых заболеваний. Однако экспериментальное исследование механизма амилоидообразования белков и структурных характеристик амилоидов является сложным из-за гетерогенности и высокого молекулярного веса агрегатов. В данной работе для определения участков полипептидной цепи апомиоглобина, образующих межмолекулярные взаимодействия в амилоидных структурах, использовались методы ограниченного протеолиза и масс-спектрометрии. Методом тандемной масс-спектрометрии удалось определить участки полипептидной цепи миоглобина, формирующие остов амилоидных структур. Показано, что основными структурными элементами формирования остова амилоидных фибрилл в миоглобине являются участки с 60 по 90 и с 97 по 124 аминокислотный остаток. Данные участки хорошо совпадают с теоретически предсказанными. Описанный подход позволил получить важную информацию о структурированности белковых молекул в агрегатах, а также о конформационных перестройках апомиоглобина в процессе амилоидообразования.
