Высокоэффективный анализ и идентификация пептидов и белков
T3N3
Высокоэффективный анализ и идентификация
пептидов и белков с использованием масс-
спектрометрии с квадрупольной ловушкой
В.Е. Франкевич, Р.Х. Зиганшин, Н.Б. Поляков, В.А. Гринкевич, А.С. Арсеньев
Институт биоорганической химии имени М.М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН.
ул. Миклухо-Маклая 16/10, 119997 Москва, Россия. E-mail: frankevich@rambler.ru
Поступила в редакцию 27.02.2006 г.; после переработки — 28.03.2006 г.
Рассматриваются способы повышения производительности системы для идентификации пептидов и белков на основе высокоэффективной жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии с квадрупольной ионной ловушкой. Показано двухкратное увеличение числа идентифицированных белков при использовании оптимизированных параметров ловушки и источника ионизации масс-спектрометра. Изменение параметров масс-спектрометра в процессе хроматографического разделения в несколько раз повышает скорость получения тандемных масс-спектров. Одновременное использование нескольких поисковых машин и баз данных позволяет значительно повысить число идентифицированных белков.