Подход к масс-спектрометрической идентификации цианобактериальных пептидов
T8N1
Подход к масс-спектрометрической
идентификации цианобактериальных пептидов.
Пример деметилмикроцистина-LR
Борис Львович Мильман1,2, Яна Владимировна Русских2,
Любовь Валерьевна Некрасова2, Зоя Андреевна Жаковская2
1 Федеральное государственное унитарное предприятие
Всероссийский научно-исследовательский институт метрологии им. Д.И. Менделеева,
Россия, 190005, Санкт-Петербург, Московский пр., 19,
E-mail: bmilman@mail.rcom.ru
2 Учреждение Российской академии наук
Санкт-Петербургский научно-исследовательский центр экологической
безопасности РАН,
Россия, 197042, Санкт-Петербург, Корпусная ул., 18
Поступила в редакцию 12.11.2010 г.; после переработки — 30.11.2010 г.
Рассмотрен общий подход к идентификации цианобактериальных пептидов, основанный на применении жидкостной хроматографии/тандемной масс-спектрометрии высокого разрешения в сочетании с априорной информацией. Алгоритм идентификации включает интерпретацию масс-спектров или, что здесь эквивалентно, сравнение экспериментальных и теоретических спектров, формируемых при использовании интерпретационно-прогнозирующей программы Mass Frontier и различных закономерностей фрагментации циклопептидов. В качестве примера выбран деметилированный вариант наиболее токсичного из микроцистинов — микроцистин-LR, присутствующий в фитопланктоне озера Сестрорецкий Разлив. Это соединение идентифицировано как [D-Asp3]микроцистин-LR, распространенный деметилмикроцистин, или, с меньшей априорной вероятностью, как позднее описанный изомер [D-Asp3, Dhb7]микроцистин-LR. Из нескольких видов тандемных масс-спектров наиболее полезным для идентификации оказался спектр фрагментов, образующихся из иона-предшественника [M+H]+ в режиме диссоциации, индуцируемой соударениями при высокой энергии. Программа Mass Frontier прогнозирует появление большинства обнаруженных осколочных ионов.
