Инверсия хроматографических порядков выхода пептидов
T8N4
Инверсия хроматографических порядков выхода
пептидов и ее значение в практике протеомных
исследований
Ирина Алексеевна Тарасова1, Татьяна Юрьевна Перлова1,
Марина Леонидовна Придатченко1, Антон Андреевич Голобородько1,
Лев Игоревич Левицкий1, Виктор Викторович Евреинов2, Вилем Гурыча3,4,
Кристоф Д. Масселон3,4, Александр Владимирович Горшков2,
Михаил Владимирович Горшков1
1 Учреждение Российской академии наук
Институт энергетических проблем химической физики РАН,
Россия, 119334, Москва, Ленинский пр., 38, корп. 2,
E-mail: iatarasova@yandex.ru
2 Учреждение Российской академии наук
Институт химической физики им. Н.Н. Семенова РАН,
Россия, 119991, Москва, ул. Косыгина, 4
3 CEA, iRTSV, Laboratoire d’Etude de la Dynamique des Prote’omes,
France, Grenoble, F-38054
4 INSERM, U880, Grenoble, F-38054, France
Поступила в редакцию 04.08.2011 г.; после переработки — 10.10.2011 г.
В работе рассмотрено явление изменения (инверсии) порядка выхода пептидов в обращенно-фазовой жидкостной хроматографии при изменении условий хроматографического эксперимента, в частности наклона градиента. На примере стандартного гидролизата шести белков и доступных лите ратурных данных были сделаны оценки масштаба и значения этого явления в протеомных исследованиях, основанных на использовании методов скорострельной протеомики и точных массово-временных меток. Показана возможность качественного и количественного описания явления инверсии порядков выхода пептидов с использованием модели жидкостной критической хроматографии. Проведен сравнительный анализ существующих подходов к предсказанию разделения пептидов и направления сдвигов хроматографических пиков пептидов при изменении профиля градиентного элюирования.
