Определение липидного состава наружного слоя бактериальной стенки
T8N4
Определение липидного состава наружного слоя
бактериальной стенки: масс-спектрометрический
подход
Юрий Николаевич Елькин1, Богдан Александрович Будник2,
Вера Борисовна Ивлева2, Евгений Львович Назаренко1,
Питер O’Коннор2 и Катерина Костелло2
1 Учреждение Российской академии наук
Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН,
Россия, 690022, Владивосток, пр. Столетия Владивостоку, 159,
E-mail: yurielkin@list.ru
2 Медицинская школа Бостонского университета, Ресурс масс-спектрометрии,
отдел биохимии медицинской школы университета Бостон,
США, Бостон, MA, 02118, ул. Албании, 670
Поступила в редакцию 26.05.2011 г.; после переработки – 25.07.2011 г.
Липидный терминал (липид А), выделенный из липополисахарида морской бактерии Marinomonas vaga ATCC 27119T, проявился в масс-спектре матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации тремя видами ионов [M–H]–, различающихся по молекулярной массе. Масса одного из них указывает на присутствие редуцированных молекул липида А, образованных только одним остатком глюкозамина вместо классической дисахаридной основы. Происхождение этого вида может быть следствием трех причин: деградации классического липида А при его выделении из липополисахарида, фрагментации молекул в масс-спектрометре и возникновения мутаций у бактерии. Не исключалось, однако, что появление пика с тем же массовым числом может быть следствием фрагментации другого липида в масс-спектрометре. При использовании повторной культивации клеток и масс-спектрометрии ионного циклотронного резонанса установлено, что мутация бактерии проявляется в шунтировании двух ступеней пути биосинтеза липополисахарида, которое и привело к обна ружению липида А с одним остатком глюкозамина. Показана эффективность масс-спектрометрии ионного циклотронного резонанса для выяснения изменений в составе липидных видов, которые произошли при культивировании бактерии и при выделении из них липида А.
