Применение высокоэффективной жидкостной хроматографии в сочетании с масс-спектрометрией высокого разрешения для изучения биодеградации и трансформации фенантрена плазмидосодержащими ризосферными бактериями Pseudomonas aureofaciens
T15N2
Анатолий Маркович Зякун, Владимир Васильевич Кочетков, Владимир Николаевич Захарченко,
Борис Петрович Баскунов, Валентина Петровна Пешенко, Кестутис Сергеяус Лауринавичюс,
Татьяна Вячеславовна Сиунова, Татьяна Орестовна Анохина, Александр Михайлович Боронин
Масс-спектрометрический анализ был применен для идентификации метаболитов и выяснения эффективности биодеградации и трансформации фенантрена ризосферными бактериями Pseudomonas aureofaciens. В работе использовали штаммы P. aureofaciens BS1393(pOV17) и P. aureofaciens BS1393(NPL-41), несущие различные плазмиды биодеградации нафталина. Штамм BS1393(pOV17) содержит природную плазмиду биодеградации нафталина pOV17, детерминирующую полное окисление нафталина до метаболитов цикла Кребса. Штамм BS1393(NPL-41) содержит мутантную плазмиду NPL-41, контролирующую только первичные этапы окисления нафталина до салициловой кислоты. При культивировании бактерий на фенантрене обнаружены метаболиты: (а) 2-гидрокси-2Н-бензо[h]хромен-2-карбоновая кислота и/или транс-4-(1-гидроксинафт-2-ил)-2-оксобут-
3-еновая кислота (М = 242 г моль–1); (б) 1-гидрокси-2-нафтойная кислота (М = 188 г моль–1) и (в) салициловая кислота (М = 138 г моль–1). Наличие метаболитов (а, б) при росте обеих культур свидетельствует об ограничении скорости процесса на этапе декарбоксилирования 1-гидрокси-2-нафтойной кислоты. В процессе роста штамма BS1393(NPL-41) образовывалась салициловая кислота как тупиковый метаболит. В то же время при росте штамма BS1393(pOV17) салициловая кислота полностью отсутствовала, что указывает на полное окисление фенантрена этим штаммом.
