Предсказательная жидкостная хроматография пептидов на основе гидрофильных взаимодействий в задачах масс-спектрометрического анализа протеомов
T14N2
Анна Александровна Лобас, Лев Игоревич Левицкий1, Андреас Фихтенбаум,
Алексей Константинович Сурин, Марина Леонидовна Придатченко,
Горан Митулович, Александр Владимирович Горшков, Михаил Владимирович Горшков
Высокоэффективная жидкостная хроматография, в том числе ее многомерные реализации, широко используется для разделения сложных пептидных смесей перед масс-спектрометрическим протеомным анализом. В двумерной хроматографии наиболее часто используемым подходом является сочетание разделения на стандартных обращенных фазах с разделением на основе гидрофильных взаимодействий (гидрофильная хроматография, HILIC). Как следствие, существенный интерес представляет разработка моделей предсказания времен удерживания биомолекул для гидрофильной хроматографии, аналогичных разработанным ранее для обращенно-фазового разделения. Существующие до недавнего времени подходы были практически исключительно основаны на суммировании индивидуальных коэффициентов удерживания аминокислотных остатков, эмпирически определяемых для конкретных условий разделения. В данной работе нами была предпринята попытка создания более общей модели для описания удерживания пептидов на стационарных фазах из немодифицированного силикагеля, основанной на термодинамической теории жидкостной критической хроматографии. Эффективность расширенной модели была продемонстрирована на примере хроматомасс-спектрометрического анализа смесей синтетических пептидов и гидролизатов белков.
Идентификация пептидов по хроматомасс-спектрометрическим данным
T5N1
Идентификация пептидов
по хроматомасс-спектрометрическим данным
с использованием расчета времен удерживания
И.А. Тарасоваа, Р.А. Зубаревб, А.А. Голобородьков, А.В. Горшковг,
М.В. Горшкова Читать полностью
Альтернативные способы проверки масс-спектрометрических методов идентификации пептидов
T7N1
Альтернативные способы проверки
масс-спектрометрических методов идентификации
пептидов в задачах «скорострельной» протеомики
Антон Андреевич Голобородько1, Корина Майерхофер2,
Александр Романович Зубарев2, Ирина Алексеевна Тарасова1,
Александр Владимирович Горшков3, Роман Александрович Зубарев2,
Михаил Владимирович Горшков1 Читать полностью
