Сравнение «низкомолекулярного» и устоявшегося подходов к видовой идентификации бактерий методом масс-спектрометрии МАЛДИ

T13N4

Борис Львович Мильман, Владимир Валерьевич Гостев,
Александр Валентинович Дмитриев

Проведено сравнение нового подхода к идентификации бактерий, который заключается в использовании программы, предназначенной для построения библиотек масс-спектров низкомолекулярных соединений и поисков в таких библиотеках, с устоявшимся подходом, основанным на коммерческой программе и базе данных Biotyper. Результаты получены для случайной выборки, составляющей 100 масс-спектров 25 штаммов видов S. pyogenes, S. dysgalactiae subsp. equisimilis и S. anginosus, из соответствующей базы данных, насчитывающей 728 масс-спектр 182 штаммов нескольких видов рода Streptococcus. Продемонстрировано, что оба подхода дают близкие результаты идентификации: 80–88 % правильных результатов. При аналогичных справочных масс-спектрах и одинаковых критериях идентификации результаты очень близки (24 совпадения из 25 штаммов). Это обусловлено тем, что различные оценки сходства спектров, заложенные в сравниваемые программы, приводят к коррелирующим показателям сходства, а различие в результатах идентификации определяется в первую очередь несовпадением справочных баз данных, а также разными критериями идентификации.

Назад к содержанию

«Низкомолекулярный» подход к идентификации микроорганизмов методом масс-спектрометрии МАЛДИ

T13N3

Борис Львович Мильман, Юрий Юрьевич Ильясов,
Наталья Владимировна Луговкина, Анна Александровна Головина,
Александр Валентинович Дмитриев

Предложен новый подход к идентификации микроорганизмов (бактерий), который заключается в преобразовании их масс-спектров МАЛДИ с уменьшением масштаба шкалы масс на порядок величины и использовании стандартной программы, предназначенной для построения библиотек масс-спектров низкомолекулярных соединений и поисков в таких библиотеках. Создана библиотека из 728 преобразованных (демасштабированных) масс-спектров 182 штаммов нескольких видов рода Streptococcus. Библиотека использована для оценки правильности идентификации микроорганизмов путем кросс-сравнения масс-спектров (внутренняя валидация метода). Правильность идентификации трех видов Streptococcus составляет 84 %, что соответствует среднему уровню правильности видовой идентификации, достигнутой при использовании масс-спектрометрии МАЛДИ и описанной в литературе. Предложенный подход к бактериальной идентификации рассматривается как основа перспективного метода выбора при решении обсуждаемых идентификационных проблем.

Назад к содержанию

Новые возможности использования диметилацеталя диметилформамида для дериватизации аналитов в хроматомасс-спектрометрии

T13N1

Игорь Георгиевич Зенкевич, Татьяна Ивановна Пушкарева

Читать полностью

Надежность идентификации модельных трипептидов с использованием электрораспылительной и тандемной масс-спектрометрии

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T3N1

Надежность идентификации модельных трипептидов
с использованием электрораспылительной и
тандемной масс-спектрометрии при сравнении
со справочными и теоретическими спектрами

Б.Л. Мильман Читать полностью

Использование индексов удерживания для хроматомасс-спектрометрической идентификации галогенсодержащих органических соединений

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T3N2

Использование индексов удерживания для
хроматомасс-спектрометрической идентификации
галогенсодержащих органических соединений

И. Г. Зенкевич, Е. В. Елисеенков, А. Н. Касаточкин Читать полностью

Масс-спектрометрическая идентификация высокотоксичных алкилфторфосфонатов

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T3N4

Масс-спектрометрическая идентификация
высокотоксичных алкилфторфосфонатов

А.T. Лебедева, К.С. Лебедевб, Б.Ф. Мясоедовв, И.В. Рыбальченков,
Г.И. Сигейкинв, В.Н. Суворкинг Читать полностью

Хроматомасс‑спектрометрическая идентификация примесей в изотопно‑обогащенном силане

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T4N2

Хроматомасс‑спектрометрическая идентификация
примесей в изотопно‑обогащенном силане

В.А. Крылова, О.Ю. Черноваб, А.Ю. Созина Читать полностью

Хроматомасс-спектрометрическая идентификация примесей

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T6N1

Хроматомасс-спектрометрическая идентификация
примесей в четыреххлористом углероде
высокой чистоты

Валентин Алексеевич Крылов1,2, Алексей Валентинович Крылов1,
Павел Валерьевич Мосягин1, Андрей Юрьевич Созин2, Алекандр Валерьевич Губинов2 Читать полностью

Хроматографическая «составляющая» хроматомасс-спектрометрической идентификации

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T6N2

Хроматографическая «составляющая»
хроматомасс-спектрометрической идентификации
продуктов хлорирования циклогексана

Игорь Георгиевич Зенкевич, Евгений Владимирович Елисеенков,
Александр Николаевич Касаточкин Читать полностью

Сверхбыстрая идентификация низкомолекулярных компонентов

ВЕРНУТЬСЯ К ОГЛАВЛЕНИЮ

T7N2

Сверхбыстрая идентификация низкомолекулярных
компонентов лекарственных препаратов методом
масс-спектрометрии DART

Елена Сергеевна Чернецова1, Павел Олегович Бочков2,
Максим Викторович Овчаров1, Георгий Валерьевич Затонский3,
Римма Александровна Абрамович1 Читать полностью